Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Fam117bQ3U3E2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms