Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec24aQ3U2P1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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