Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf149Q3U2C5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms