Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms