Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 417.7 ms