Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms