Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarca4Q3TKT4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms