Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms