Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RubcnlQ3TD16 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RubcnlQ3TD16 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms