Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms