Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms