Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm1Q2TV84 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm1Q2TV84 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms