Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms