Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlrp1aQ2LKU9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms