Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms