Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ptchd1Q14B62 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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