Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gli2Q0VGT2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms