Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms