Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms