Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms