Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms