Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms