Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q08AU9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q08AU9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q08AU9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q08AU9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q08AU9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q08AU9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms