Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb2Q08331 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms