Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms