Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ebf1Q07802 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms