Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms