Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox4Q06831 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms