Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms