Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms