Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd1Q04519 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms