Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnb1Q03717 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms