Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff2Q03404 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms