Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aplp1Q03157 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aplp1Q03157 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms