Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GscQ02591 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GscQ02591 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GscQ02591 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GscQ02591 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GscQ02591 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms