Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms