Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms