Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2aQ01320 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2aQ01320 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2aQ01320 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2aQ01320 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Top2aQ01320 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Top2aQ01320 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Top2aQ01320 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Top2aQ01320 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Top2aQ01320 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Top2aQ01320 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2aQ01320 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2aQ01320 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Top2aQ01320 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2aQ01320 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2aQ01320 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2aQ01320 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Top2aQ01320 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2aQ01320 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms