Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms