Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms