Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms