Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcf7Q00417 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms