Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms