Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms