Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smn1P97801 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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