Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms