Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Arf1P84078 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf1P84078 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Arf1P84078 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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