Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux2P70298 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux2P70298 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux2P70298 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cux2P70298 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms