Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp7P70280 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms