Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfixP70257 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfixP70257 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfixP70257 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfixP70257 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfixP70257 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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NfixP70257 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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NfixP70257 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfixP70257 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfixP70257 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfixP70257 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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